研究揭示肺癌临床样本的基因组、三维基因组和转录组之间的关系

时间：2021-06-16 11:15:22   来源 网络   作者：网络

染色质在细胞核中折叠成高度复杂的三维结构，并且在细胞分化增殖等过程中被动态调控。染色质构象捕获技术如Hi-C等可以捕捉基因组范围的高分辨率染色质相互作用，帮助我们更好地理解三维基因组和细胞功能之间的关系。肺癌是目前发病率和死亡人数最高的癌症之一，与肺癌相关的组学研究涵盖基因组、表观遗传学、转录组和蛋白组等，但与三维基因组相关的研究较少，特别是直接采用临床癌症样本的研究。

在这项研究中，研究者首先证明了用少量细胞 (1×10^4 ) 的Hi-C实验研究临床肺癌样本三维基因组的可行性（图1）。然后从两例肺癌病人中分别提取癌症和癌旁组织, 进行Hi-C和RNA-seq测序，获得三维基因组和转录组信息。